Колагенът е амфолит, който зависи от два фактора, първо, колагенът има много киселинни или основни странични групи на пептидна верига; второ, всяка пептидна верига има -карбоксилни и -амино групи, които могат да приемат или даряват протони и те могат да се дисоциират в определен диапазон на pH, за да генерират положителни или отрицателни заряди. С други думи, с pH на средата различните колагени се зареждат положително. или отрицателно заредени йони. Стойностите на pKa на страничните групи на колагеновите пептидни вериги са малко по-различни от тези на страничните групи на съставните аминокиселини, което се дължи на влиянието на съседни заряди в протеиновата молекула. Изоелектричната точка е 7,5~7,8, което е алкално, тъй като в пептидната верига на колагена има повече основни аминокиселини, отколкото киселинни аминокиселини. Тъй като е полимер, той има колоидни свойства и определен вискозитет във воден разтвор. Вискозитетът е най-нисък в изоелектричната точка и колкото по-ниска е температурата, толкова по-голям е вискозитетът.
