Относителната молекулна маса на колагена е голяма. В изображението на електрофорезата има 3 плувни ленти. Двете плувни ленти, които се появяват близо до 100kD, са съответно веригата 1 и веригата 2 на молекулата на колагена. Плувната лента 1, която се появява близо до 200 kD, е веригата на молекулата на колагена. Това означава, че относителната молекулна маса на всяка полипептидна верига от колаген може да достигне 100 kD, а относителната молекулна маса на една молекула колаген е 300 kD. Методите за определяне на молекулното тегло на полипептида са често използвани SDS-PAGE, гел хроматография и масспектрометрия. Някои хора използват хроматография с гел филтрация, за да определят разпределението на молекулното тегло на колагеновия хидролизат в дехромирани кожени остатъци при около 16,1 kD. Разпределението на молекулното тегло на колагенови олигопептиди от кожата на камбала, определено чрез времепролетна масспектрометрия, основно концентрирано в 0.6-1.8kD. Молекулното тегло на колагеновия полипептид, хидролизиран от животинска протеаза, е 2-7kD, което е по-широко от това на колагеновия полипептид, хидролизиран от растителна протеаза.
